(1)氧化还原电位：利用测定氧化还原电位的方法判定厌氧反应器内的多个氧化还原组分系统是否平衡状态，虽然这种方法可靠性较差，但由于氧化还原电位测定简单，和其他监测指标结合起来应用，有一定的指导意义。
(2)丙酸盐和乙酸盐浓度比：如果厌氧反应器有机负荷超过 [#]54
正常范围，在其他运行参数发生变化之前，丙酸盐和乙酸盐浓度之比会立即升高。因此可以将丙酸盐和乙酸盐浓度之比作为厌氧反应器超负荷引起运行异常的灵敏而可靠的警示指标。
(3)挥发性酸VFA:挥发性酸的异常升高是厌氧反应器中产甲烷菌代谢受到抑制的有效指标。
(4)苯乙酸：苯乙酸是降解芳香组氨基酸和木质素等大分子有机物产生的中间产物，当处理含有这类污染物的污水时，厌氧处理出水中苯乙酸含量是比挥发性酸更为敏感的反映厌氧反应器运行状态的指标。
(5)甲硫醇：甲硫醇气味独特，即使含量很低，人们也能凭嗅觉感觉出来。甲硫醇含量突然增加（气味突然出现或加大)往往表明进水中氯代烃类有毒物质含量突然增加。
(6)—氧化碳CO: C0的产生与甲烷的产生密切相关，C0难溶于水，可以实现在线监测。气相中C0的含量和液相中乙酸盐的浓度有良好的相关性，C0的含量变化与重金属和由有机毒性所引起的抑制作用也有关系。
4.厌氧生物反应器维持高效率的基本条件
(1)适宜的PH值：为使厌氧顺利进行，反应器中的pH值必须在6.5~ [#].2之间。
(2)充足的常规营养：反应器内氮的浓度必须在40?70mg/L范围内才能满足需要，而磷和硫化物维持较低的浓度即可满足需要。甲烷菌对硫化物和磷有专性需要，必须在反应器内保证其含量，有时需要向进水中投加磷肥和硫酸盐。
(3)必要的微量专性营养元素：对甲烷菌有激活作用的专性营养元素有铁、钴、镍、锌、锰、钼、铜甚至硒、硼等很多种，缺少其中一种就可能严重影响整个生物处理过程。
(4)合适的温度：厌氧反应一般在30~37t：的中温条件下运行。
(5)对毒性适应能力：必须完成厌氧微生物对有毒物质适应性的驯化。
(6)充足的代谢时间：要同时保证厌氧生物处理的水力停留时间HRT和固体停留时间SRT。
(7)适量的碳源：来自进水中的有机物要满足异养型甲烷菌用于生物合成所需要的碳源，同时反应器内的溶解性C02要满足自养型甲烷菌所需要的碳源。
(8)污染物向微生物的传质良好：厌氧生物反应器内的颗粒污泥在流化状态下传质能力较好，但生物量过多积累或使用厌氧生物膜法时生物膜过厚都可能产生传质问题，要定期排出剩余生物污泥或提高回流比减少部分传质阻力。
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