有机物污染主要来源于食物、植物、粪便、动物尸体中的有机成分以及其它人工合成的有机物。有机污染物大量消耗水中的溶解氧，危及鱼类的生存。导致水中缺氧而使需氧微生物死亡。这类微生物能够分解有机质，维持水体的自净功能。它们死亡的后果是：水体发黑，变臭，毒素积累，伤害人畜。随着工农业的迅猛发展，产生了大量含有复杂有机物组分的污水，一些高稳定的有机合成化合物，如多氯联苯、有机氯农药等也污染水质，造成很大的危害。这些物质也是经过食物链的富集，后进人人体，引起慢性中毒。如滴滴涕的慢性中毒能影响神经系统，破坏肝功能，造成生理障碍，甚至可能影响生殖和遗传，产生怪胎和引起癌症等。因此在当前水体污染问题中，以有机物污染的矛盾很突出。
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